Isso foi resolvido. A chave é que os volumes desduplicados precisam ter o sinalizador de desistência desativado antes da exclusão. Isso deve ser feito no nível do pool, bem como no nível de zvol ou de sistema de arquivos. Caso contrário, a exclusão estará essencialmente sendo desduplicada. O processo leva tempo porque a tabela de deduplicação do ZFS está sendo referenciada. Neste caso, a RAM ajuda. Eu adicionei temporariamente 16 Gigabytes adicionais de RAM ao sistema e coloquei o servidor novamente online. O zpool importado completamente dentro de 4 horas.
A moral é provavelmente que a desduplicação não é super polida e que a RAM é essencial para o seu desempenho. Estou sugerindo 24 GB ou mais, dependendo do ambiente. Caso contrário, deixe a dedução do ZFS desativada. Definitivamente não é razoável para usuários domésticos ou sistemas menores.