Você não especificou a versão do Subversion que seu servidor está executando. Mas com base na mensagem que você forneceu na pergunta, é provavelmente uma versão 1.4.x ou mais antiga. Não me lembro se havia um comando de upgrade fornecido ou não para conversão de 1.4.x para 1.5.x, mas a maneira segura de obter o seu repositório da versão 2 para a versão é para um dump e load. Mas isso não importa muito, você vai querer instalar o 1.6.x de qualquer maneira para ir com o mais recente. Então, aqui estão os passos que você precisa fazer:
- Atualize para o Subversion 1.6.x se ainda não tiver
- Descarregue seu repositório existente usando o svnadmin dump
- Crie um novo repositório, chame-o _new
- Carregue seu novo repositório com o despejo do antigo usando svnadmin load
- Copie o arquivo uuid do repositório antigo para o novo repositório
- renomeie o repositório antigo para _old
- renomeie o novo repositório para
Veja também o link do Subversion para obter um exemplo concreto.
Isso deve ajudá-lo e o arquivo uuid evitará que seus clientes entrem em pânico. Faça um svn update para ter certeza.