Você precisa descobrir onde está o seu gargalo ...
Eu corro um monitor nagios que verifica mais de 400 hosts com verificações http, ping e ssh. (juntamente com muitas outras verificações passivas e nscd)
Isso está em um servidor 2xQuadCore com 4 discos SAS no RAID10.
Eu suspeito que você esteja tendo contenção de IO, já que escrever para muitos rrds é muito ineficiente.
Você precisa descobrir qual processo está ocupando seus recursos. (cactos, nagios ou outra coisa)
Para a verificação de E / S, gosto do iotop. Instale o iotop (o pacote 9.04 funciona em 8.04)
Caso contrário, o top também deve ajudá-lo a encontrar o seu porco de carga.
O Cacti uma vez por minuto é bastante agressivo. (Eu corro o meu em intervalos de 5m)
Uma abordagem da qual ouvi falar para a contenção de escrita rrd é colocar suas lojas rrd em um ramdisk / tmpfs. (Certifique-se de rsync que de vez em quando para armazenamento persistente)
Boa sorte.