Em primeiro lugar, as gravações simultâneas definitivamente não são uma opção para o armazenamento MyISAM. Cada um deles irá bloquear uma tabela inteira (exceto para leitura em alguns casos). Se o InnoDB não combina com você, tente o TokuDB. Mas será mais lento se comparado ao MyISAM devido à natureza transacional do mecanismo TokuDB (e InnoDB, é claro) (você deve gravar os mesmos dados pelo menos duas vezes: arquivos de diário e de dados). Além disso, se o seu servidor travar algum dia, você estará esperando por horas até que seus reparos de tabela MyISAM 40Gb.
Se você ainda quiser carregar dados em suas tabelas MyISAM e quiser fazê-lo rapidamente, recomendo usar LOAD DATA INFILE em vez de inserções. Essa é a maneira mais rápida de carregar grandes volumes de dados na tabela. E sim, os índices retardarão o desempenho da inserção de maneira exponencial.
Uma palavra sobre partições: instruções INSERT no MySQL não suportam a remoção, então todas as suas partições serão escaneadas em cada instrução para uma correspondência de índice única. Além disso, todas as partições serão bloqueadas até o final da inserção.