I know how to change the time and I belive we setup an NTP server on the DC and ensured time-sync was turned off on Hyper-V.
As máquinas virtuais não podem controlar o tempo. Você pode querer tentar configurar o DC como um cliente NTP. Este blog pode ser útil.
O cara waffles por um pouco, mas role para baixo e você obterá as entradas de registro necessárias. Este artigo da KB parece um pouco mais autoritário.
Há também um artigo da Technet sobre como configurar um controlador de domínio para usar o NTP:
Por que isso acontece, a VMware tem um writeup sobre timekeeping com VMs (não o HyperV, mas os conceitos ainda se aplicam).