O NTFS é um pouco mais refinado do que o RWX, portanto, neste exemplo, estou apenas redefinindo a ACL para o padrão. Se você tiver uma coleção específica de ACE , por favor, adicione-os à sua pergunta. Além disso, se as próprias permissões da unidade forem desconfiguradas, precisaremos corrigi-las também.
Assumindo que a árvore está enraizada em D: \ files:
REM Make local administrators group owner.
takeown /F D:\files /R /A /D Y
REM Reset ACLs to defaults.
icacls D:\files /reset /T /C /L /Q