Isso depende de quão complicado é o layout do seu grupo e se você fez muitas aprovações / recusas personalizadas para determinados grupos. Também depende se você se importa com o histórico e o status atual dos computadores no banco de dados.
Se você tiver uma configuração muito simples em que esteja apenas aprovando todas as atualizações e não se importar com o histórico de nenhum dos computadores, não será necessário fazer backup do banco de dados ou das atualizações. Provavelmente, levaria menos tempo para reconstruir o serviço a partir do zero (dependendo da rapidez com que sua conexão de rede é para a Microsoft) do que da restauração do backup. Todas as suas máquinas existentes irão apenas fazer o check-in com o novo servidor assim que estiver pronto.
É uma análise de risco básica para qualquer serviço. Se você tiver dados que seriam caros (tempo ou dinheiro) ou impossíveis de recriar a partir do zero, faça o backup. Caso contrário, não se incomode.