Uma solução para enviar a versão correta para navegadores que não aceitam o gzip seria algo como:
RewriteCond %{HTTP:Accept-Encoding} !gzip
...your rules here...
Além disso, há outra maneira de alterar o tipo, a saber:
<FilesMatch .*\.css.gz>
ForceType text/css
</FilesMatch>
<FilesMatch .*\.js.gz>
ForceType text/javascript
</FilesMatch>
HTH.