Não, o DFS-R não replicará as cópias de sombra do VSS. Cada servidor manteria suas próprias cópias de sombra. No entanto, se você tiver replicação bidirecional e restaurar a partir de uma cópia de sombra local no servidor B, ela será replicada para o Server-A, desde que esse arquivo ainda não exista de forma idêntica.
Se o hash da pasta for diferente, o que significa que o arquivo no Servidor A não existe ou é diferente de uma replicação iniciada. Se o arquivo existir, mas for diferente, uma versão "vencerá" e a outra será movida para a pasta DFSR Conflict and Deleted.
Também é importante observar que simplesmente copiar um arquivo de uma cópia de sombra não preservará as informações de registro de data e hora no arquivo. Isso pode causar grandes complicações com o DFS-R. Fazer uma "restauração" preservará essa informação.