Eu corri esta configuração exata. MegaCli tem uma opção útil chamada algo como CfgEachDskRaid0, que irá configurar todos os discos da matriz como raid0, garantindo uma configuração consistente.
Não é verdade que é impossível fazer hot swap de discos com esta configuração, embora seja desajeitado (especialmente porque o próprio MegaCli dificilmente é um modelo de usabilidade), basicamente envolve a desconfiguração do antigo ataque array e reconfigurando um novo toda vez que você quiser trocar um disco.