Use uma ferramenta de referência como bonnie (++). É fácil de instalar em todas as distribuições e, como ele mede diferentes aspectos, você obtém uma boa imagem de como o sistema funciona em uma determinada situação.
Se você quiser apenas usar ferramentas básicas, você pode usar o dd:
Para velocidade de gravação:
dd if=/dev/zero of=outputfile bs=512 count=32M
(O produto de bs e count deve ser pelo menos duas vezes o tamanho da memória RAM)
Para velocidade de leitura:
dd if=outputfile of=/dev/null
Lembre-se que esta é uma estimativa muito grosseira e mede uma situação que é improvável que ocorra em operações normais.