Tente: fsck -pvcf - forçará uma verificação detalhada de blocos inválidos e reparará automaticamente. Se você ainda tiver problemas, seu HDD poderá ter problemas físicos.
Parece fsck.ext4 sair muito em breve, acho que apenas verifica os logs de diário e não faz nada se o diário estiver limpo. É isso? Como forçá-lo para verificar todo o sistema de arquivos? Eu tentei a opção -f , mas ela encerra novamente dizendo que está limpa muito rapidamente.
Na minha máquina, e2fsck -fv <ext4-device> demora muito, cerca de dois a quatro minutos (o dispositivo tem cerca de 360 GiB cheio). Então eu suponho que faz um cheque completo! Eu costumo usar e2fsck -vfp -C0 <ext4-device> , " -p " faz correção automática, " -C0 " imprime progresso para stdout e " -v " é para "detalhado".