Você pode passar parâmetros adicionais via diretiva fastcgi_param. Tenho certeza porque usei essa funcionalidade.
Minha configuração nginx exemplificativa
server {
server_name localhost;
include conf/defaults.conf;
root /var/www;
location ~* "\.php$" {
fastcgi_param CRS "crs";
include conf/fastcgi-php.conf;
}
}
E parte da saída do phpinfo ():
...
_SERVER["USER"] fcgi
_SERVER["HOME"] /dev/null
_SERVER["FCGI_ROLE"] RESPONDER
_SERVER["REMOTE_USER"] no value
_SERVER["CRS"] crs
_SERVER["QUERY_STRING"] no value