Isso parece ser um comportamento esperado e ocorre quando você cria seu controlador de domínio .
Os encaminhadores de DNS são preenchidos automaticamente quando o controlador de domínio é promovido, de acordo com um conjunto de regras que é mal documentado pela Microsoft, mas que o colega da página vinculada parece ter enumerado bem. Eu verifiquei e o comportamento de preenchimento automático no Server 2012 R2 parece estar inalterado no Server 2008 R2. A única palavra oficial da Microsoft que eu foi capaz de encontrar sobre o assunto é este post no blog da Technet .
Faz sentido, pelo menos na medida em que copia encaminhadores de DNS externos - presumivelmente, você desejaria os mesmos para todos os seus controladores de domínio ou, no mínimo, desejaria que todos os controladores de domínio tivessem um encaminhador externo. que seus clientes podem realizar pesquisas de DNS para domínios externos.