linux OOM-kill por quê?

Question

Saudações, colegas administradores. Eu poso na esperança de lançar luz sobre as matanças da OOM que assombram uma das máquinas da minha empresa. Eu não posso decidir se eles são ou não legítimos.

É um Centos 6.x com o kernel 2.6.32-279.1.1.el6.x86_64.

Ram 8 gb, cpu athlon2-x4.

Os grandes processos são o mysql e o vmware player 4, com um máximo de respectivamente 2 e 4 GB de memória RAM alocados constantemente, além de alguma sobrecarga. (VMware é aquele que é morto, devido ao seu tamanho maior).

Existem daemons rodando além destes 2, mas eles são muito pequenos e muito carregados, então eu não entendo onde o restante 1 / 1.5 gig de ram iria desaparecer, sem contar o enorme swap ...

Além disso, as mortes acontecem somente enquanto ele executa os cronjobs de backup à noite. (Estes são scripts de shell simples com ferramentas padrão que descarregam alguns bancos de dados e zipam alguns diretórios da web e de caixas de correio.)

Aqui, por exemplo, ele estava fazendo um mysqldump - e é a primeira vez que acontece com essa tarefa em particular.  Ela costumava acontecer quase todas as vezes, também associada a 'falha de alocação de página', quando eu executava rsyncs ou zips de uma árvore de diretórios grande (~ 1 milhão de arquivos pequenos). Mas eu mudei tudo isso para outra máquina com zfs: após essa operação, o assassino me deixou sozinho, por um tempo ..

Eu odeio isso depois de fazer malabarismos com o problema por meses, lendo e lendo cada tópico da internet, mas ainda não consigo relacionar as informações com o meu caso. Há swap, por que não troca em vez de matar? E quem leva todo o carneiro de qualquer maneira? (No começo havia alguns leakers de memória legítimos e eu os consegui.) Também não pode ser fragmentação, já que as solicitações com falha são do pedido zero.

Eu colei alguns dados antes dos registros de kill reais:

vm.swappiness = 100
vm.vfs_cache_pressure = 5000
vm.min_free_kbytes = 262144

(estes eu adicionei para tentar consertá-lo, eles provavelmente são um pouco extremos, mas funcionam sem problemas)

Eu experimentei, em vão, com overcommit_memory = 2 também. Isso não deveria desabilitar o assassino?

Este é o status normal da memória do sistema. Observe que a memória RAM do vmware conta como cache, devido ao vmem mmap-ed. E, a propósito, o VMware está configurado para permitir a recuperação / troca de memória vm. E isso não acontece nunca.

           total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:       7800792    7400032     400760          0      61100    4449196
-/+ buffers/cache:    2889736    4911056
Swap:      8388600     761588    7627012

SwapCached:       286648 kB
PageTables:        40200 kB
CommitLimit:    15409312 kB
Committed_AS:    8099460 kB
AnonHugePages:    192512 kB

Node 0, zone      DMA      4      1      1      3      1      1      0      0      1      1      3 
Node 0, zone    DMA32    378   1476   2541   1491    328    240     74     28      8      0      0 
Node 0, zone   Normal   1555    124    956   1825    659    175     54     31     15      0      0 

Finalmente, a OOM:

Jan  2 21:37:38  : vmware-vmx invoked oom-killer: gfp_mask=0xd0, order=0, oom_adj=0, oom_score_adj=0
Jan  2 21:37:38  : vmware-vmx cpuset=/ mems_allowed=0
Jan  2 21:37:38  : Pid: 19635, comm: vmware-vmx Not tainted 2.6.32-279.1.1.el6.x86_64 #1
Jan  2 21:37:38  : Call Trace:
Jan  2 21:37:38  : [] ? cpuset_print_task_mems_allowed+0x91/0xb0
Jan  2 21:37:38  : [] ? dump_header+0x90/0x1b0
Jan  2 21:37:38  : [] ? __delayacct_freepages_end+0x2e/0x30
Jan  2 21:37:38  : [] ? security_real_capable_noaudit+0x3c/0x70
Jan  2 21:37:38  : [] ? oom_kill_process+0x82/0x2a0
Jan  2 21:37:38  : [] ? select_bad_process+0xe1/0x120
Jan  2 21:37:38  : [] ? out_of_memory+0x220/0x3c0
Jan  2 21:37:38  : [] ? __alloc_pages_nodemask+0x89e/0x940
Jan  2 21:37:38  : [] ? alloc_pages_current+0xaa/0x110
Jan  2 21:37:38  : [] ? __get_free_pages+0xe/0x50
Jan  2 21:37:38  : [] ? __pollwait+0xb4/0xf0
Jan  2 21:37:38  : [] ? eventfd_poll+0x7d/0x80
Jan  2 21:37:38  : [] ? do_sys_poll+0x29b/0x520
Jan  2 21:37:38  : [] ? __pollwait+0x0/0xf0
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? pollwake+0x0/0x60
Jan  2 21:37:38  : [] ? read_tsc+0x9/0x20
Jan  2 21:37:38  : [] ? ktime_get_ts+0xa9/0xe0
Jan  2 21:37:38  : [] ? poll_select_set_timeout+0x8d/0xa0
Jan  2 21:37:38  : [] ? sys_ppoll+0x4c/0x180
Jan  2 21:37:38  : [] ? system_call_fastpath+0x16/0x1b
Jan  2 21:37:38  : Mem-Info:
Jan  2 21:37:38  : Node 0 DMA per-cpu:
Jan  2 21:37:38  : CPU    0: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jan  2 21:37:38  : CPU    1: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jan  2 21:37:38  : CPU    2: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jan  2 21:37:38  : CPU    3: hi:    0, btch:   1 usd:   0
Jan  2 21:37:38  : Node 0 DMA32 per-cpu:
Jan  2 21:37:38  : CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd: 175
Jan  2 21:37:38  : CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:  40
Jan  2 21:37:38  : CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd: 180
Jan  2 21:37:38  : CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd: 152
Jan  2 21:37:38  : Node 0 Normal per-cpu:
Jan  2 21:37:38  : CPU    0: hi:  186, btch:  31 usd: 170
Jan  2 21:37:38  : CPU    1: hi:  186, btch:  31 usd:  67
Jan  2 21:37:38  : CPU    2: hi:  186, btch:  31 usd: 108
Jan  2 21:37:38  : CPU    3: hi:  186, btch:  31 usd:  63
Jan  2 21:37:38  : active_anon:1467089 inactive_anon:263165 isolated_anon:64
Jan  2 21:37:38  : active_file:12404 inactive_file:65792 isolated_file:96
Jan  2 21:37:38  : unevictable:2 dirty:66080 writeback:1 unstable:0
Jan  2 21:37:38  : free:73888 slab_reclaimable:8971 slab_unreclaimable:10661
Jan  2 21:37:38  : mapped:780904 shmem:1035969 pagetables:10566 bounce:0
Jan  2 21:37:38  : Node 0 DMA free:15688kB min:500kB low:624kB high:748kB active_anon:0kB inactive_anon:0kB active_file:0kB inactive_file:0kB unevictable:0kB isolated(anon):0kB isolated(file):0kB present:15284kB mlocked:0kB dirty:0kB writeback:0kB mapped:0kB shmem:0kB slab_reclaimable:0kB slab_unreclaimable:0kB kernel_stack:0kB pagetables:0kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:0 all_unreclaimable? yes
Jan  2 21:37:38  : lowmem_reserve[]: 0 3254 7799 7799
Jan  2 21:37:38  : Node 0 DMA32 free:127608kB min:109180kB low:136472kB high:163768kB active_anon:2209600kB inactive_anon:441980kB active_file:35784kB inactive_file:207948kB unevictable:8kB isolated(anon):0kB isolated(file):256kB present:3333024kB mlocked:8kB dirty:211888kB writeback:0kB mapped:955900kB shmem:1376604kB slab_reclaimable:20276kB slab_unreclaimable:6460kB kernel_stack:488kB pagetables:8856kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:580800 all_unreclaimable? no
Jan  2 21:37:38  : lowmem_reserve[]: 0 0 4545 4545
Jan  2 21:37:38  : Node 0 Normal free:152256kB min:152456kB low:190568kB high:228684kB active_anon:3658756kB inactive_anon:610680kB active_file:13832kB inactive_file:55220kB unevictable:0kB isolated(anon):256kB isolated(file):128kB present:4654080kB mlocked:0kB dirty:52432kB writeback:4kB mapped:2167716kB shmem:2767272kB slab_reclaimable:15608kB slab_unreclaimable:36184kB kernel_stack:3016kB pagetables:33408kB unstable:0kB bounce:0kB writeback_tmp:0kB pages_scanned:410848 all_unreclaimable? no
Jan  2 21:37:38  : lowmem_reserve[]: 0 0 0 0
Jan  2 21:37:38  : Node 0 DMA: 4*4kB 1*8kB 1*16kB 3*32kB 1*64kB 1*128kB 0*256kB 0*512kB 1*1024kB 1*2048kB 3*4096kB = 15688kB
Jan  2 21:37:38  : Node 0 DMA32: 240*4kB 925*8kB 1553*16kB 748*32kB 253*64kB 152*128kB 56*256kB 28*512kB 6*1024kB 0*2048kB 0*4096kB = 127608kB
Jan  2 21:37:38  : Node 0 Normal: 1155*4kB 1362*8kB 2962*16kB 860*32kB 330*64kB 113*128kB 23*256kB 18*512kB 9*1024kB 1*2048kB 0*4096kB = 152380kB
Jan  2 21:37:38  : 1162322 total pagecache pages
Jan  2 21:37:38  : 48040 pages in swap cache
Jan  2 21:37:38  : Swap cache stats: add 3148787, delete 3100747, find 1726176/2015458
Jan  2 21:37:38  : Free swap  = 7750696kB
Jan  2 21:37:38  : Total swap = 8388600kB
Jan  2 21:37:38  : 2031600 pages RAM
Jan  2 21:37:38  : 81402 pages reserved
Jan  2 21:37:38  : 1987047 pages shared
Jan  2 21:37:38  : 707527 pages non-shared
Jan  2 21:37:38  : [ pid ]   uid  tgid total_vm      rss cpu oom_adj oom_score_adj name
Jan  2 21:37:38  : [  457]     0   457     2673       90   1     -17         -1000 udevd
Jan  2 21:37:38  : [ 1261]     0  1261    62271      293   0       0             0 rsyslogd
Jan  2 21:37:38  : [ 1275]     0  1275     1171       91   0       0             0 mdadm
Jan  2 21:37:38  : [ 1284]    81  1284     5382      159   1       0             0 dbus-daemon
Jan  2 21:37:38  : [ 1295]    70  1295     6946      160   2       0             0 avahi-daemon
Jan  2 21:37:38  : [ 1296]    70  1296     6914       27   1       0             0 avahi-daemon
Jan  2 21:37:38  : [ 1344]    68  1344     6292      346   0       0             0 hald
Jan  2 21:37:38  : [ 1345]     0  1345     4524      152   0       0             0 hald-runner
Jan  2 21:37:38  : [ 1391]     0  1391     5053       87   2       0             0 hald-addon-inpu
Jan  2 21:37:38  : [ 1406]     0  1406     6014      103   2       0             0 vmware-usbarbit
Jan  2 21:37:38  : [ 1420]     0  1420    16028      119   1     -17         -1000 sshd
Jan  2 21:37:38  : [ 1439]    38  1439     7539      146   0       0             0 ntpd
Jan  2 21:37:38  : [ 1483]     0  1483    29309      135   2       0             0 crond
Jan  2 21:37:38  : [ 1494]     0  1494     5362       47   2       0             0 atd
Jan  2 21:37:38  : [ 1511]   501  1511    25371     5751   1       0             0 Xvnc
Jan  2 21:37:38  : [ 1521]   501  1521    26513       66   0       0             0 sh
Jan  2 21:37:38  : [ 1532]   512  1532    21634      461   0       0             0 Xvnc
Jan  2 21:37:38  : [ 1541]   501  1541     5006       82   1       0             0 dbus-launch
Jan  2 21:37:38  : [ 1542]   501  1542     5382      141   2       0             0 dbus-daemon
Jan  2 21:37:38  : [ 1546]   501  1546     5629      283   0       0             0 xfconfd
Jan  2 21:37:38  : [ 1551]   501  1551    28034       71   3       0             0 gpg-agent
Jan  2 21:37:38  : [ 1561]   501  1561    57668      351   1       0             0 xfce4-session
Jan  2 21:37:38  : [ 1565]   501  1565    49604      290   2       0             0 xfsettingsd
Jan  2 21:37:38  : [ 1567]   501  1567    55385      549   1       0             0 xfwm4
Jan  2 21:37:38  : [ 1569]   501  1569    59719     1148   2       0             0 xfce4-panel
Jan  2 21:37:38  : [ 1571]   501  1571    56642      311   1       0             0 Thunar
Jan  2 21:37:38  : [ 1573]   501  1573    81823      695   3       0             0 xfdesktop
Jan  2 21:37:38  : [ 1582]   501  1582    56799      339   1       0             0 xfce4-settings-
Jan  2 21:37:38  : [ 1584]     0  1584   520550      188   1       0             0 console-kit-dae
Jan  2 21:37:38  : [ 1650]   501  1650    55456      487   3       0             0 panel-6-systray
Jan  2 21:37:38  : [ 1654]   512  1654    26513       65   0       0             0 sh
Jan  2 21:37:38  : [ 1669]   512  1669     5006       68   2       0             0 dbus-launch
Jan  2 21:37:38  : [ 1670]   512  1670     5383      135   0       0             0 dbus-daemon
Jan  2 21:37:38  : [ 1674]   512  1674     5629      264   3       0             0 xfconfd
Jan  2 21:37:38  : [ 1680]   512  1680    28034       70   3       0             0 gpg-agent
Jan  2 21:37:38  : [ 1683]   500  1683    27549     6909   2       0             0 Xvnc
Jan  2 21:37:38  : [ 1694]   512  1694    57667      346   2       0             0 xfce4-session
Jan  2 21:37:38  : [ 1699]   512  1699    55386      461   1       0             0 xfwm4
Jan  2 21:37:38  : [ 1701]   512  1701    66152     1404   2       0             0 xfce4-panel
Jan  2 21:37:38  : [ 1703]   512  1703    56617      235   0       0             0 Thunar
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Jan  2 21:37:39  : [32639]    89 32639    19924      722   0       0             0 pickup
Jan  2 21:37:39  : [ 4973]    48  4973   136179     4973   3       0             0 httpd
Jan  2 21:37:39  : [ 4976]    48  4976   138478     7371   0       0             0 httpd
Jan  2 21:37:39  : [ 4977]    48  4977   136173     4777   3       0             0 httpd
Jan  2 21:37:39  : [ 5662]     0  5662    35030      336   0       0             0 crond
Jan  2 21:37:39  : [ 5663]     0  5663     2297      282   2       0             0 sh
Jan  2 21:37:39  : [ 5664]     0  5664     2298      302   0       0             0 bash
Jan  2 21:37:39  : [ 5665]     0  5665    15910      437   0       0             0 mutt
Jan  2 21:37:39  : [ 5947]     0  5947     2298      337   1       0             0 bash
Jan  2 21:37:39  : [ 6416]    48  6416   110170     2070   3       0             0 httpd
Jan  2 21:37:39  : [ 6625]    48  6625   110170     1895   0       0             0 httpd
Jan  2 21:37:39  : [ 6642]     0  6642    32679     1632   2       0             0 mysqldump
Jan  2 21:37:39  : Out of memory: Kill process 19635 (vmware-vmx) score 199 or sacrifice child
Jan  2 21:37:39  : Killed process 19635, UID 501, (vmware-vmx) total-vm:6774496kB, anon-rss:74020kB, file-rss:3099352kB

    

Answer 1

Bem, acho que seu min_free_kbytes é muito alto. Eu tenho uma máquina de 16GB e meu min é 67584kB.

Note that vmware's ram counts as cache, because of the mmap-ed vmem

Isso nem sempre é verdade. Somente se o arquivo mmapped () for aberto em MAP_SHARED, isso é verdade. Outras páginas sujas são suportadas por swap. Qual é o caso para você parece. Se você adicionar o uso relatado desse processo dado na parte inferior da sua saída e convertê-lo em páginas (4k). É igual ao RSS reportado no dump da tarefa para esse processo.

rss:74020kB, file-rss:3099352kB
74020 + 3099352 = 3173372
3173372 / 4 = 793343

é igual a ..

[19635]   501 19635  1693624   793343   1       0        0 vmware-vmx

Por que você matou OOM. Bem, isso é um pouco mais complicado.

Quando você alcança min , o kernel deseja recuperar a memória até high watermark bytes. O kernel, portanto, tem uma verificação; se a quantidade de memória disponível para recuperar o cache de arquivos não for suficiente para colocá-lo de volta na marca d'água high dessa zona, ele não se importará em liberar o cache de arquivos e ir direto para a recuperação da memória anônima.

Nós nunca reivindicamos active . Então -

if (file_inactive > zone_high - free_mem) then
   reclaim (zone_high - free_mem) file inactive pages
else
   reclaim from anonymous pool

No seu caso, isso é 55220 is not greater than 228684-152456 (76428) .

A razão pela qual isso é um OOM-Kill e não troca é porque quando você quebra a marca min , o kernel entra em um modo direct_reclaim . Neste modo, fazer I / O para liberar memória não pode ser realizado porque pode causar um impasse.

Seu host estaria trocando no momento, mas seu host está alocando mais rápido do que pode trocar.

A melhor maneira de corrigir isso seria reduzir sua min watermark para algo menor ou, melhor ainda, obter mais memória e / ou reduzir a quantidade de coisas que você executa na máquina.