Como você mencionou o IE 11, gostaria de ativar o modo empresarial, que foi lançado na atualização de abril de 2014. Ele permite que você selecione uma lista de sites, reforçada pelo GPO, e execute-os em uma camada "IE8" restrita. Pelo menos, essa é a versão curta.
A parte mais interessante é o fato de que a lista é um arquivo XML, você pode definir subdomínios e caminhos. Veja o exemplo na Technet: link
Quando configurados via GPO, os navegadores do IE 11 procurarão uma URL para um arquivo XML e usarão as instruções desse arquivo para renderizar sites no modo apropriado. Eu pessoalmente nunca entrei nos Modos de Compatibilidade do IE, mas até agora estou amando o EMIE. Posso executar com êxito aplicativos de intranet baseados em ActiveX antigos no mesmo navegador que as guias HTML5.
O EMIE também permite rastrear o uso do recurso por meio de um registrador HTTP GET (aplicativo IIS). Se um site não estiver na lista e um usuário disparar manualmente o Modo Empresarial, o IE poderá ser configurado para enviar uma notificação para um URL. O URL grava em um log e esses dados podem ser usados para refinar sites adicionais para a lista EMIE XML.