Estranho - copiar e colar sua resposta e executar o nome-checagem de verificação resulta em:
acshellam@dev1:/tmp$ named-checkzone example.com example.com.zone
zone example.com/IN: loaded serial 12
OK
acshellam@dev1:/tmp$ named-checkzone -v
9.6.1-P2
Tem certeza de que é o arquivo de zona correto que você tem no seu sistema? Existe uma diretiva $ ORIGIN em algum lugar entre os registros NS e A no seu arquivo que está alterando a raiz da zona?