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Se você não tem muitos sub-módulos (e você não está mudando ou atualizando-os com frequência), basta substituí-los pelos arquivos estáticos.
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Muitas pessoas na comunidade PHP estão começando a se afastar do gerenciamento de dependências com submodules do Git para usar o link do Composer. Isso pode tornar parte de seu fluxo de implementação mais simples.
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Existe também uma solução descrita aqui link O último comentário (1 de agosto , 2013 1:37 PM por oquismail) mostra como modificar arquivos de configuração do bean de feijão Elastic
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Você pode considerar o gerenciamento de implantações por meio do link (ferramentas de linha de comando baseadas em Python para gerenciar aplicativos do Amazon Elastic Beanstalk. )