Nós usamos ZABBIX para monitorar 10 servidores e 100 clientes.
ZABBIX is an enterprise-class open source distributed monitoring solution.
ZABBIX is software for monitoring of your applications, network and servers.
Você pode monitorar coisas como largura de banda, uso de cpu, memória total, memória livre, número de processos, espaço livre no disco rígido, tempo de atividade etc. Ele possui alguns modelos muito bons para monitorar Exchange, SQL e Linux.