Você pode usar LockHunter para ver qual processo está bloqueando a exclusão de um arquivo. É uma ferramenta freeware para Windows (disponível nas versões de 32 e 64 bits) que se integra ao menu de contexto do Windows Explorer.
It is a free tool to delete files blocked by something you do not know. LockHunter is useful for fighting against malware, and other programs that are blocking files without a reason. Unlike other similar tools it deletes files into the recycle bin so you may restore them if deleted by mistake.
Screenshot do LockHunter http://lockhunter.com/images/mainScreenshot.png