Muito simplesmente: o universo (e / ou Murphy) está punindo você por continuar a usar um protocolo completamente obsoleto e inseguro como o FTP.
Quando você se conecta ao seu servidor web usando FTP, seu nome de usuário e senha são enviados sem criptografia, claro, para que todos e o Big Brother leiam. O mesmo acontece com o conteúdo de todos os arquivos que você envia ou faz download usando o FTP. Por razões de segurança, sugiro strongmente mudar para o SFTP, que é um recurso embutido do SSH. Qualquer provedor de hospedagem na web que valha a sua empresa suporta SSH e SFTP.
Quaisquer problemas de FTP que você possa ter no lado do servidor quase certamente não se aplicarão ao usar o SFTP, porque as conexões SFTP são tratadas por um daemon / serviço completamente separado no servidor.
Ao contrário de FTPS, FTPES, etc., as implementações SSH / SFTP são interoperáveis de maneira bastante consistente. É improvável que você tenha problemas estranhos e imprevisíveis ao transferir arquivos via SFTP.