O ponto geral aqui é que ter dois conjuntos de arquivos em diferentes discos físicos (ou volumes RAID) torna as coisas muito mais rápidas quando ambos os conjuntos são acessados ao mesmo tempo; é por isso que o O.S. geralmente obtém seu próprio volume (faz um pouco de I / O por conta própria, e você não quer que ele diminua ao fazer um enorme trabalho com dados), e também é por isso que você geralmente deseja divida seus dados com base em seus padrões de uso.
Dito isso, um ponto ainda mais importante com o SQL Server é que os logs de transações geralmente não são acessados ao mesmo tempo que os arquivos de dados, separando os dois uma boa opção, mas também você precisará de pelo menos um -los se você quer ser capaz de realmente recuperar as coisas no caso de uma falha de hardware. Se você perder os logs de transação, basta criar outro conjunto, mas os dados reais estarão seguros ... e, se perder os dados, os registros de transação permitirão a recuperação do último backup até o ponto da falha. Se você perder dados e registros ao mesmo tempo, só poderá restaurar seu último backup, nada mais.
A melhor opção em seu cenário seria criar três volumes RAID 1, um para o O.S., um para os arquivos de banco de dados e um para os logs de transação. Eu sei que isso parece um grande desperdício de espaço (o sistema operacional não usa nenhum 500 GB e, portanto, os logs de transação se você seguir um plano de backup adequado), mas ajudará muito quando chegar para desempenho e recuperação. E, se você não precisar de mais de 500 GB de dados reais, ele funcionará muito para você.
Se você não puder fazer isso, use um volume RAID 1 para o O.S. e logs e um volume RAID 10 para os dados. Isso é o melhor que você pode fazer com o hardware que você tem. Mas, faça o que fizer, você realmente não deve colocar os dados e os logs no mesmo lugar.
Sobre várias partições: isso é totalmente inútil e pode até piorar as coisas. Três partições no mesmo disco (ou RAID) executam exatamente o mesmo que uma única partição (= mal) ou, pior ainda, devido a problemas de geometria do disco; e isso não ajuda na recuperação, porque no caso de uma falha de hardware, você perderá todos eles de qualquer maneira.
Ah, e para o seu próprio bem, nem mesmo pense em usar o RAID 5, se você se importar com o desempenho de gravação.