Em sua definição de host, você pode especificar o comando que deseja usar.
define host{
use generic-host
host_name SVR_1
alias SVR_1
address 10.0.0.6
check_command check-host-alive
max_check_attempts 2
notification_interval 120
notification_period 24x7
notification_options d,u,r
}
Então, normalmente no checkcommands.cfg você faria um novo comando com o que você queria, ou você poderia simplesmente usar o check_http.
define command{
command_name check-host-alive
command_line $USER1$/check_ping -H $HOSTADDRESS$ -w 3000.0,80% -c 5000.0,100% -p 1
}