Os clusters de failover exigem armazenamento compartilhado. Sem ela, se uma máquina morre, os dados neles ficam inacessíveis e não há como fazer o failover sem os dados.
Eu não acredito que haja algum método integrado tolerante a falhas de usar as unidades locais. Para máquinas virtuais em cluster, você precisa de armazenamento compartilhado e as unidades internas não se qualificam.
O que você pode fazer, especialmente se isso é temporário enquanto você faz manutenção ou atualizações de SAN, perde a tolerância a falhas. Se você estiver usando o SCVMM, desmarque "Tornar esta máquina virtual altamente disponível". Se você estiver usando o gerenciador de cluster de failover, remova a máquina virtual do gerenciador do cluster (ela ainda existirá no host físico). Em seguida, use o gerenciador do Hyper-V para movê-lo para o armazenamento local.
Quando você faz isso, você perde a tolerância a falhas - se um host físico morrer, qualquer VM nesse host o acompanhará. Você ainda poderá usar a versão não em cluster da Live Migration para movê-los entre os hosts durante a operação normal - mas isso significará mover os arquivos do disco também, portanto, levará mais tempo.
Quando terminar, mova os discos de volta para o armazenamento compartilhado e torne-os altamente disponíveis novamente.