Este é o problema com os switches básicos, se tivesse sido algo como um catalisador cisco ou um HP procurve, ele pode ter detectado atividade errática na porta e encerrado, isso significaria, é claro, que você não teria DNS se você tiver apenas um controlador de domínio e nenhuma maneira de os usuários efetuarem login, mas a rede, pelo menos, estará efetivamente "ativa". Meu conselho é investir em um par de switches de 24 portas e dar a eles uma configuração básica, depois agrupar os NICs de seus DCs e afins para que, caso isso aconteça novamente, o switch desligue a porta defeituosa.
Com relação à solução de problemas do NIC existente, se houver hardware defeituoso que saiba o que está lançando na rede, talvez se você fizer download de algo como wireshark e executá-lo em um PC cliente quando conectar o outro NIC. veja o tráfego que está criando ou para onde seus pacotes estão indo. Também para testar se é um problema de hardware ou software, você pode tentar um live cd do linux, como o Ubuntu 10.10. Se você carregar isso na RAM e testar a NIC (CDs ao vivo não tocam no HD, então é seguro rodar para diagnósticos de hardware) você será capaz de ver se é software (sua instalação do Windows) ou hardware.