Não, a situação que você descreve não é possível. Um controlador de domínio não replicará um objeto de um esquema diferente do seu. O Active Directory é um pouco mais esperto do que isso. :)
De T echNet :
Effect of Schema Changes on Replication
Attribute definitions are stored in attributeSchema objects in the schema directory partition. Changes to attributeSchema objects block other replication until the schema changes are performed. During replication of any directory partition other than the schema directory partition, the replication system first checks to see whether the schema versions of the source and the destination domain controllers are in agreement. If the versions are not the same, the replication of the other directory partition is rescheduled until the schema directory partition is synchronized.
Assim, a replicação de objetos simplesmente será suspensa até que a atualização do esquema seja replicada.
Se você observar a saída de repadmin, observará erros ao mencionar que a replicação está falhando devido a uma incompatibilidade de esquema.