A verdadeira resposta aqui é provavelmente apenas fornecer os termos de pesquisa corretos para que você possa fazer uma comparação de produtos. Acho que você está falando sobre "virtualização de aplicativos", "streaming de aplicativos" ou "sequenciamento de aplicativos", dependendo do produto. Algumas opções incluem o XenApp, o App-V, o SVS e o ThinApp.
O único sobre o qual eu sei alguma coisa é App-V , mas acho que provavelmente é demais sobrecarga para o que você quer fazer. Existem muitas outras pessoas que precisam fazer a mesma coisa, ou isso é só para você?
Edit: Acabou de encontrar este em outra pergunta semelhante sobre o ServerFault .