Você usa o ADMT ( Ferramenta de migração do Active Directory ) para reestruturar e mesclar domínios, no entanto, com sua falta de familiaridade com o AD (desculpe, não quero parecer condescendente) e com quanto tempo você levaria para aprender o ADMT, e quantos usuários você tem, o mais rápido para aprender você provavelmente migraria todas as estações de trabalho para um novo domínio manualmente.
Edite para elaborar mais - sugiro a USMT (User State Migration Tool) para migrar os perfis de usuário para o novo domínio, mas, como com o ADMT, sua utilidade realmente brilha em projetos de migração grandes . Para um pequeno número de usuários, você provavelmente só usaria a Transferência Fácil do Windows para transferir perfis de usuário ... mesmo que a migração de perfis de usuários não seja essencial para você, provavelmente deixará seus usuários mais felizes e será uma vitória fácil para você.