As desvantagens do nohup são que você não pode se reconectar ao processo depois que o pai sai, e você tem que percorrer as etapas extras para garantir que a saída seja capturada corretamente. Com tela ou tmux, você ainda pode interagir com o shell.
Quando preciso iniciar um processo em segundo plano em um servidor de baixa importância, costumo usar nohup:
nohup ./server.sh &
A maioria dos colegas parece preferir a tela:
screen -D -R mydaemon
./mydaemon.sh
^A ^D
Existem diferenças importantes no efeito dessas duas abordagens? Quais são os benefícios de uma forma ou de outra?