Definitivamente, o administrador anterior não fez um bom trabalho.
Então, primeiro de tudo, se você adicionar as seguintes linhas no seu vsftpd.conf, você irá chroot usuários em seu diretório home.
chroot_list_enable=YES
chroot_local_user=YES
# a list of users which are NOT to be placed in a chroot() jail
chroot_list_file=/etc/vsftpd/chroot_list
Para gerenciar usuários, você pode criar um virtual (dê uma olhada aqui ), mas se você acha que a solução é muito complexa, use o módulo pam_listfile.so para negar aos usuários FTP o acesso ou uso ssh pam_shells.so . O que for mais fácil para você. Apenas tome cuidado para não bloquear o servidor ssh para usuários válidos:)