Força a instalação da versão 5.5.9+dfsg-1ubuntu4
sudo apt-get install php5-common=5.5.9+dfsg-1ubuntu4
A versão 5.5.9+dfsg-1ubuntu4
não pode ser instalada normalmente, porque sua versão instalada possui um número de versão superior.
Depois de ler seus comentários e sua pergunta atualizada, seu sistema está bastante acelerado. Por que você usa PPAs ou instala arquivos deb se não sabe como lidar com isso?
Eu suspeito que você tenha usado PPAs de aqui . Portanto,
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Adicionar novamente os PPAs
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Atualize seu sistema. Precisamos de um estado definido
sudo apt-get update sudo apt-get dist-upgrade
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Decida se você quer manter os PPAs
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Se sua resposta for yes , pare aqui
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Se sua resposta for não , leia
Instale um pequeno ajudante
sudo apt-get install ppa-purge
Limpar os PPAs, por exemplo,
ppa:ondrej/apache2
sudo ppa-purge ppa:ondrej/apache2
Repita o passo anterior para todos os PPAs que você não deseja manter
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