Instalar o global express geralmente não é uma boa ideia, a maneira como a maioria dos módulos de nó funciona é ser instalada por repo para que qualquer um possa recriar o ambiente executando npm install .
Assim, a maneira recomendada de instalar o express é executar npm install express --save , o que não só fará o download do módulo mas também crie uma entrada no package.json do projeto.
O Express nunca é executado diretamente a partir da linha de comando, mas é adicionado usando require() em app.js ou em um arquivo executado por ele. Um exemplo de como fazer isso é expressar o Olá mundo oficial.