É assim que o debconf funciona, você não esperaria que os pacotes fossem reconfigurados automaticamente se você acabou de editar o arquivo.
O que você quer é um manipulador de notificação que reconfigure o dpkg uma vez no final da reprodução.
- debconf:
name: 'btsync'
question: 'btsync/folder_defaults-use_dht'
value: 'true'
vtype: 'boolean'
notify: reconfigure btsync
e no seu arquivo de manipuladores:
- name: reconfigure btsync
command: sudo dpkg-reconfigure -f noninteractive btsync
Agora, se o debconf realmente mudou alguma coisa (e somente se - idempotent), o btsync será reconfigurado uma vez quando todas as suas tarefas forem executadas.