O IIS executa o PHP e a maioria dos outros aplicativos FastCGI muito bem se existir um filtro ISAPI para ele. Dito isto, eu quase gostaria de usar o Web Farm Framework , um módulo para o IIS, bem como talvez o conjunto de ferramentas Web Deploy.
Essencialmente você configura um servidor mestre que você configura da maneira que você quer das configurações do IIS para MySQL e PHP e simplesmente configura o IIS para servir páginas para aquele aplicativo. Uma vez que tudo isso esteja configurado, você pode simplesmente ativar outros servidores "secundários" no farm e eles sincronizarão automaticamente todas as configurações do aplicativo e do servidor.
Além disso, se existir um pacote Web Platform Installer para determinados componentes, como PHP e MySQL, ele será automaticamente instalado e corrigido também para você. Por último, mas não menos importante, o sistema garantirá que cada máquina também tenha o nível idêntico de atualizações do Windows, o que poderia resultar em coisas aqui e ali.
Uma das coisas legais sobre isso é como as menções do @ChrisS, o PowerShell é o ambiente de script do Windows e, nessa medida, o Web Farm Framework também tem cmdlets do PowerShell para facilitar a administração remota do próprio serviço.
Há muitos documentos de ajuda aqui . Observe que a versão atual é 2.2