Não deve, pois os dois modos de compatibilidade são separados (DFS e AD). Fizemos a mesma transição de 2012 até 2016. Se você deixar o servidor DFS em 2008, ele ainda deverá funcionar com um nível de domínio de 2016. Apenas não altere um dos seus servidores DFS para um modo de compatibilidade mais alto sem fazer o outro.