dd apenas lê do bloco 0 ao bloco 99999 e copia os dados.
O Clonezilla entende os sistemas de arquivos e entende quando não há nada para ser copiado (porque é um espaço vazio ou dados de um arquivo que foi deletado).
Depois de saber que não copia todos os dados inúteis, é muito mais fácil copiar os dados reais.
Na página web "Para o sistema de arquivos não suportado, a cópia setor a setor é feita por dd no Clonezilla."