Eu acredito que provavelmente tem mais a ver com o legado do que com o avanço. Apesar do fato de que A e B foram tomados e C tornou-se a atribuição padrão do disco rígido, a maioria dos aplicativos supõe que C é o local padrão do SO, A e B são disquetes e D é unidades de CD-ROM ou DVD.
Eu vi aplicativos quebrarem se o sistema operacional padrão não estiver localizado em C.