38C deve estar bem. Uma rápida olhada em algumas folhas de especificações mostra que a temperatura operacional é de 0 a 60 graus em muitos modelos.
Você pode estar interessado na seção 3.4 de um estudo feito pelo Google sobre as taxas de falha no disco rígido. A temperatura não é um problema nos drives até que eles sejam alguns anos mais antigos e, mesmo assim, parece que não é um problema muito menor do que 40C.