Na primeira parte, você pode ser vítima da velocidade de reconstrução lenta padrão do MD.
Um bom artigo sobre as opções está em:
Mas resumindo:
sysctl -w dev.raid.speed_limit_min=1000
sysctl -w dev.raid.speed_limit_max=100000
Para garantir entre 1 e 100MB disponíveis para recriações, se o servidor estiver ativo, o min é uma boa maneira de acelerar as coisas, mas ao custo de alguma capacidade de resposta.