Você pode tentar desativar a atualização java via regedit: link
O que fazemos no trabalho é criar instalações MSI (ou baixá-las) e modificar seus parâmetros de instalação do MSI para que ele não verifique atualizações automaticamente. Vou postar os parâmetros reais amanhã. Você pode fazer isso e reinstalar para que os novos parâmetros possam ser aplicados.