O principal problema é poder clonar a máquina que você está usando.
Eu obtive sucesso usando o Acronis TrueImage em um Windows 2000 Server e convertendo a imagem com o VmWare Converter.
Se possível, você poderia fazer isso durante a noite em um momento muito morto.
O CD de inicialização do Acronis pode salvar a imagem na rede para que você não tenha certeza de tocar em nada no seu servidor original.
Para restaurar e trabalhar, é claro, REALMENTE SEJA CERTO trabalhar o mais longe possível da sua LAN de produção.
Basta colocar um pc solitário com vmware e o servidor que você está convertendo e se você precisar experimentar conexões de clientes diferentes, conecte um único switch onde conectar o servidor e os clientes e certifique-se de que NONE nunca tenha problemas.
Seguindo meu conselho e todos os outros usuários, você deve ser capaz de configurar o sistema que permitirá que você "toque" o quanto quiser e limpe o código.
Verifique novamente cada passagem, seja calmo e preciso e ninguém vai se machucar:)