Essa unidade não é realmente compatível com o Windows XP, pois usa um tamanho de setor 4K maior - isso deve explicar os problemas de desempenho.
Há uma ferramenta de alinhamento especial da WD para Formatos Avançados você precisa usar ou definir o jumper correto se for hospedar somente uma partição.
Está na hora de fazer upgrade do Windows XP, pois esse tipo de solução alternativa dos fabricantes de unidades provavelmente não será fornecido no futuro.