Eu suportei sua configuração exata com 70 sites de WAN no Windows Server 2003 R2, principalmente com o T-1. Funcionou muito bem. O DFSR era o nosso método de backup do servidor de arquivos WAN. Você pode usar o MRTG para monitorar a largura de banda do seu roteador T-1 para verificar quaisquer problemas de largura de banda?
Usamos o MRTG para ver gráficos de uso de largura de banda e GPOs baseados em site para controlar a largura de banda usada para BITS no DFSR. Nós definimos os GPOs para usar ~ 700kb durante o dia e maximizar o T-1 à noite. Às vezes, tivemos casos em que os backlogs aumentavam e, se eles nunca se esvaziavam, sabíamos por meio do monitoramento do servidor e do MRTG que a única opção era obter mais largura de banda. O DFSR já está compactado e em nível de bloco, portanto, não sei se outras soluções de terceiros para replicar dados externos o tornarão melhor (se você puder realmente mostrar que ele é limitado à largura de banda).
DFSR em 2008 ou 2008 R2 pode ter otimizações adicionais, então pesquise essa opção de atualização também.