Você teria, teoricamente, problemas se você vivesse migrasse suas VMs de um processador AMD para um processador Intel (ou seja, vMotion), portanto, o vSphere não permitirá um vMotion nesse cenário. Se você desligar a VM e, em seguida, iniciá-la novamente no novo processador, você estará bem, desde que o sistema operacional convidado não seja particularmente dependente do processador. (Na maior parte, isso é o Windows 2000 e sistemas operacionais mais antigos.)