Acesse o site da LSI e baixe a ferramenta CLI para o seu cartão RAID. Dependendo do driver que você está usando (o do LSI ou o padrão do kernel), você pode fazer praticamente qualquer coisa, incluindo desligar o alarme.
MegaCli -AdpSetProp AlarmSilence -a0
ou MegaCli -AdpSetProp AlarmSilence -a1 (dependendo do slot instalado)