Sim, você pode fazer isso, no entanto, o nome DNS público das instâncias será alterado sempre que uma instância for iniciada. As melhores opções são usar o IP elástico (EIP) ou trabalhar atrás de um balanceador de carga elástica (ELB). Ambas as opções seria melhor para apontar uma entrada DNS e seria capaz de permanecer o mesmo nas reinicializações da instância. Você usaria uma entrada CNAME para o ELB e poderia usar um registro A ou CNAME para a opção EIP. A vantagem da opção ELB é que você pode ter várias instâncias do EC2 por trás, oferecendo maior tolerância a falhas.