O truque é que você precisa renomear a ação e o alias também para que eles não sejam 'redefinições', então, para o meu conjunto 'www', minha configuração vhost tem esta aparência:
<IfModule mod_fastcgi.c>
<FilesMatch \.php$>
SetHandler php-script
</FilesMatch>
Action php-script /php5-www.fcgi virtual
Alias /php5-www.fcgi /var/fastcgi/php5-www.fcgi
FastCGIExternalServer /var/fastcgi/php5-www.fcgi -socket /var/run/php5-fpm-www.sock
<Directory "/var/fastcgi">
Order allow,deny
<Files "php5-www.fcgi">
Order deny,allow
Deny from all
Allow from env=REDIRECT_STATUS
</Files>
</Directory>
</IfModule>
E para SSL no mesmo pool:
<IfModule mod_fastcgi.c>
<FilesMatch \.php$>
SetHandler php-script
</FilesMatch>
Action php-script /php5-www-ssl.fcgi virtual
Alias /php5-www-ssl.fcgi /var/fastcgi/php5-www-ssl.fcgi
FastCGIExternalServer /var/fastcgi/php5-www-ssl.fcgi -socket /var/run/php5-fpm-www.sock
<Directory "/var/fastcgi">
Order allow,deny
<Files "php5-www-ssl.fcgi">
Order deny,allow
Deny from all
Allow from env=REDIRECT_STATUS
</Files>
</Directory>
</IfModule>
Então, eles estão usando nomes diferentes, mas apontando para o mesmo soquete.