De link
Domain Controller OU
When domain controllers are added to the domain, their computer objects are automatically added to the Domain Controller OU. This OU has a default set of policies applied to it. To ensure that these policies are applied uniformly to all domain controllers, it is recommended that you do not move the computer objects of the domain controllers out of this OU. Failure to apply the default policies can cause a domain controller to fail to function properly.
Acho que o maior problema ocorre quando os DCs são colocados em UOs separadas que não têm a diretiva DC padrão aplicada, embora seja uma boa ideia mantê-los na UO de Controladores de Domínio, se eles estiverem em um recipiente de nome diferente. de qualquer maneira.