A entropia disponível é utilizada principalmente pela criptografia (para estabelecer conexões SSL, por exemplo) e também por cada programa que chama random () ou lê de / dev / random e / dev / urandom.
Mas no seu caso, estou pensando que a entropia disponível é uma conseqüência das consultas lentas do mysql, e não uma causa.
Entropia é coletada pelo kernel a partir de fontes de atividade aleatória em seu hardware, como interrupções, IOs de rede ou atividade de disco rígido.
Parece a quantidade de picos de entropia disponíveis exatamente quando o mysql ficou lento, e isso pode ser porque o mysql acionou a atividade do disco rígido (como reconstruir vários índices ou liberar um cache para o disco ou trocar) e essa atividade gerou entropia no pool de entropia.
Veja seus parâmetros de ajuste do mysql, e monitore seus IOs de disco, uso de memória / troca, etc ... nos mesmos períodos. Entropia não é muito provável que seja a causa de seus problemas, mas talvez uma conseqüência normal. A causa é provavelmente o mysql (ou algum outro daemon no seu sistema) consumindo recursos do sistema ao invés de servir consultas.