Você também pode remover a capacidade da Diretiva de Grupo de realmente aplicar essa configuração configurando as permissões sem o Sistema. Mark Russinovich tem um bom artigo sobre como fazer isso.
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Isto é ligeiramente melhor que uma Tarefa Agendada para alterar o valor do registro. Eu não chamaria isso de elegante, embora:)
Mas, realmente, a maneira correta de fazer isso é desabilitar a Diretiva de Grupo (como Chris Thorpe disse) ou desabilitar a herança para a UO do servidor e criar outro GPO sem essa diretiva específica.
EDIT: Você também pode usar o filtro WMI para excluir esse servidor específico de receber toda a política. Observe que, se um determinado GPO for filtrado, as políticas do GPO INTEIRO não serão aplicadas. Se você seguir esse caminho, eu recomendaria que a diretiva de conexão do Terminal Server fosse dividida em um novo GPO, para que o restante das configurações não seja ignorado.
Informações do Microsoft TechNet: link
Filtrando com base no nome do computador (role para baixo até a resposta):
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